Põhimääruse kohaselt täidab Riigilaevastik riigi veesõidukite (välja arvatud Kaitseväe ja Kaitseliidu veesõidukite registris olevate veesõidukite), navigatsioonimärgistuse haldamise, jäämurdetööde teostamise ning lootsiteenuse osutamise ja arendamisega seotud ülesandeid.
Alates 1. juulist 2023 osutab Riigilaevastik lootsiteenust kohustusliku lootsimise alla minevatele laevadele, mis Eesti sadamaid ja merealasid külastavad.
Samuti panustab Riigilaevastik koos Transpordiametiga Eesti veeliikluse ohutusse ja veeteede taristu korrashoidu. Riigilaevastiku ülesandeks on üldkasutatavate veeteede ujuvmärgistuse ja püsimärgistuse tulede haldamine ja arendamine ning jäämurdetööde tegemine. Navigatsioonimärgistuse ning jäämurdetööde valdkonna üldvastutus on Transpordiametil.
- Riigilaevastik loodi selleks, et seni erinevate asutuste - Transpordiameti, Politsei- ja Piirivalveameti, Päästeamet, Keskkonnaameti ja AS-i Eesti Loots opereeritavad veesõidukid koondada ühte asutusse võimaldamaks veesõidukeid efektiivsemalt kasutada ja riigi veesõidukite parki ühtselt arendada.
- Riigilaevastikku loomine aitab riigil tagada läbipaistva, efektiivse, konkurentsivõimelise ja toimiva struktuuri veesõidukite haldamiseks.
- Riigilaevastik tagab pikaajalise vaate riigi veesõidukipargi arendamiseks, sh saartega ühenduste pidamises, hõlbustades investeerimist multifunktsionaalsetesse laevadesse ning soosides uute tehnoloogiate, sh suurema autonoomsusega laevade ja rohetehnoloogiate kasutuselevõtmist.
